wp-admin/css/wp-admin.css
wp-admin/includes/meta-boxes.php
wp-admin/js/post.js
wp-includes/js/quicktags.js
wp-includes/formatting.php

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テキスト変換機能（680x0 や -- などが勝手に化ける問題）を無効化

wp-includes/ フォルダにある formatting.php の wptexturize() 関数の冒頭に return $text; を追加し、以下のようにします。

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記事の編集画面で「カテゴリー」にスクロールバーを出さない

wp-admin/css/ フォルダにある wp-admin.css から、以下の部分を探します。

height: を min-height: に変更します。

同じコードがもう一つあるので、そちらも同様に変更します。

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記事の編集画面の「カテゴリー」でチェック状態で並び替えない

wp-admin/includes/ フォルダにある meta-boxes.php から、以下の部分を探します（post_categories_meta_box 関数の中にあります）。

$popular_ids の直後に , 'checked_ontop' => false を追加します。

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記事の編集画面の「タグ」で日本語変換の確定時に勝手にタグを追加しない

wp-admin/js/ フォルダにある post.js から、以下の部分を探します（co.keyup ではない方）。

これを .keypress に変更します。

その少し後ろに以下のコードがあるので削除します。

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記事の編集画面から使わないクイックタグを削除

wp-include/js/ フォルダにある quicktags.js から、以下の部分を探して削除します。